domingo, 15 de diciembre de 2019

ADN recombinante artificial en Leucemia Linfoide Aguda

A pesar de que la terapia génica en LLA con líneas celulares del paciente esta en auge de investigación, desde la década de los 80`s se ha incursionado en la producción de proteínas recombinantes tales como inmunomodulares. La interleukina-2 (IL-2) fue descubierta en 1976 y su gen, ubicado en el cromosoma 4 que genera un polipéptido de 153 aminoácidos, fue clonado en 1984, por transformación del vector a una célula E. coli K12. Desde entonces se desarrollaron múltiples ensayos clínicos que demostraron la actividad antitumoral de IL-2 siendo utilizada en quimioterapia y posteriormente se pensó que la IL-2 podría erradicar la enfermedad mínima residual tras un Trasplante de Médula Ósea (TMO), para ello se analizó satisfactoriamente la tolerancia al régimen de tratamiento, efectos inmunológicos, pero no aumento la supervivencia libre de enfermedad de pacientes con neoplasia linfoide en remisión completa con alto riesgo de recaída.

REFERENCIAS 

lunes, 9 de diciembre de 2019

Recombinación de ácidos nucleicos en la naturaleza

Actualmente el mundo vive un proceso alarmante debido a enfermedades reemergentes, aquellas que reaparecen después de décadas, y enfermedades emergentes relativamente nuevas a causa de virus o agentes acelulares infecciosos que han sufrido un proceso de evolución, variabilidad genética, por recombinación y mutación genética. Así aparecen enfermedades como el Dengue, la gripe aviar, la fiebre amarilla, el Zika, la fiebre hemorrágica de Crimea-Congo, el Ébola, la fiebre del valle del Rift y del Nilo, etc. La recombinación sucede generalmente cuando dos virus han infectado la misma célula al mismo tiempo, aquí intercambian regiones similares de sus genomas virales ya sea ADN o ARN, o redistribuyen fragmento que sean diferentes.





REFERENCIAS

domingo, 1 de diciembre de 2019



MICRORRAY, RT-PCR Y NORTHERNBLOT: INVESTIGACIÓN SOBRE LA REGULACIÓN DE miRNA`s POR ACCIÓN DE GLUCOCORTICOIDES (GC)


Para analizar la eficiencia del tratamiento, se estudiaron muestras de 13 niños con ALL sometidos a monoterapia con GC sistémica. Las matrices Exon y U133 detectan transcripciones primarias de genes que contienen miRNA, sus transcripciones poliadeniladas y pre-miRNA procesados ​​por Drosha. Para determinar si su expresión se reguló después de 6 h y / o 24 h de exposición a GC, se emplea RT-PCR en tiempo real y experimentos de transferencia Northern, identificando que GC aumentan la expresión del gen que codifica miR-223 (DQ680071) y SMC4, que contiene miR-15b y -16-2 en uno de sus intrones. Estos miRNA`s inducen apóptosis, pues su objetivo es inhibir la expresión deBCL2 y BCL-XL. Hasta la actualidad se estudia la función de los miRNA`s en la regulación de genes que cofican o no proteínas que promueven la eficiencia de los fármacos.

REFERENCIAS 
Umerez M, Thesis IP. MiR-Pharmacogenetics in Childhood Acute Lymphoblastic Leukemia
Treatment. 2018. Disponible en: https://addi.ehu.es/handle/10810/32356

jueves, 21 de noviembre de 2019

Secuenciación completa de exoma (WES) y del transcriptoma masivo (RNA-Seq) para priorizar tratamientos contra Leucemia Linfoide Aguda.

A partir de una muestra de tumor primario T-ALL (médula ósea) se realiza extracción de ADN con el kit QIAamp DNA y análisis de WES con una plataforma de secuenciación Illumina HiSeq2000 Miniusó; a su vez se  extrae ARN total utilizando el reactivo TriPure, tras eliminar ARN ribosómico, se procede a secuenciar con el instrumento Illumina HiSeq2500, los datos de RNA-Seq se interpretan utilizando el algoritmo predictivo EricScript. Esta técnica molecular se emplea para identificar alteraciones genéticas relevantes que incluyen variantes genéticas, niveles de expresión génica, transcripciones de fusión y variantes alternativas de empalme; datos utilizados por plataformas bioinformáticas como Pandrugs, que tras una selección de información, sugiere una lista de fármacos específicos para cada paciente con el objetivo de mejorar la efectividad de sus tratamientos, reducir los efectos secundarios no deseados y favorecer su tasa de supervivencia.

REFERENCIA

domingo, 17 de noviembre de 2019

Técnica de retrotranscripción - reacción en cadena de polimerasa (RT-PCR) en Leucemia Linfoide Aguda

Para el diagnóstico y seguimiento del proceso de remisión (enfermedad mínima residual) en pacientes con Leucemia Linfoblástica Aguda se emplea varias pruebas de laboratorio; entre ellas se encuentran las técnicas moleculares, mismas que cumplen un rol determinante desde hace ya algunos años y se mantienen hasta la actualidad. 



En el ¨Estudio del reordenamiento molecular de los genes TEL/AML1 en la leucemia linfocítica aguda¨ se empleo el RT-PCR para demostrar la existencia de una translocación críptica, la t (12;21) (p12;q22) en la LLA de tipo B, que no se detecta por las técnicas citogenéticas convencionales e involucra los oncogenes TEL y AML1. Así se clasifica en un subgrupo a los pacientes con este marcador que indica una evolución favorable.

Para la investigación se estudió un total de 20 pacientes pediátricos con diagnóstico de LLA-B, en edades que oscilaron entre 1 y 14 años. En el momento del estudio, 18 pacientes se encontraban en la etapa de diagnóstico inicial y 2 en recaída hematológica, de quienes se obtuvo ARN.

Extracción de ARN
1. El aislamiento de leucocitos de muestras de médula ósea o sangre periférica mediante un        gradiente de Ficoll-Telebrix 38 según el método convencional.
2. Purificación del ARN por el método de fenolcloroformo.
3. La integridad del ARN se comprobó con una electroforesis en gel de agarosa al 1,5 %.

Genes: Síntesis del ADNc con la enzima reverso transcriptasa y técnica de PCR para la amplificación del ADNc de la fusión TEL/AML 1 según el protocolo de BIOMED.

Reacción de PCR - máquina MJ-Research, INC. Versión 1.2.
1. Desnaturalización a 94 ° C, 1 min                   
2. Hibridación a 65 ° C, 1 min                                   35 ciclos
3. Elongación a 72 ° C, 1 min

Visualización: Electroforesis
Sensibilidad y especificidad: no se indica, pero si se manifiesta que se realiza una segunda reacción de PCR (anidado o nested)

REFERENCIAS:

domingo, 10 de noviembre de 2019

Pruebas de Tamizaje y Complementarias para el diagnóstico de Leucemia Linfoide Aguda


Ante signos y síntomas de la leucemia linfoide aguda en edad pediátrica, se recomienda realizar pruebas paraclínicas: hemograma con recuento de plaquetas, extendido de sangre periférico, función hepática, renal, electrolitos (Na, K, Cl, Ca, fósforo), DHL, ácido úrico, hemoclasificación, fenotipo del Rh, pruebas de coagulación, coprológico. Descartar la existencia de infecciones bacterianas, virales (CMV, VEB, hepatitis B/C y HIV).  
Para un diagnóstico confirmatorio es necesario tomar muestra de sangre periférica, aspirado de médula ósea y biopsia para realizar estudio morfológico, inmunológico, genético y biología molecular.

REFERENCIA

sábado, 2 de noviembre de 2019

Alteraciones de la Epigenómica en Leucemia Linfoide Aguda


Las alteraciones genéticas son la base de la etiología de la LLA, pero son necesarias alteraciones epigenéticas, tales como: la hipermetilación del DNA en regiones promotoras, la sobreexpresión de enzimas desacetilasas de histonas o la expresión alterada de microARNs, para el desarrollo leucémico.

La metilación del DNA es el mecanismo epigenético más ampliamente estudiado en la LLA; consiste en la adición covalente de grupos metilo al carbono 5 de la citosina del DNA, principalmente en la secuencia promotora 5’-CpG-3’, conocida como isla CpG. Esto conlleva al silenciamiento en la expresión de los genes TIE1, MOS, CAMLG, GPRC5C, involucrados en señalización; MCTSI y DGKG, que participan en regulación del ciclo celular y proliferación; PABPN1 y PABPC5, que participan en metabolismo de RNA; PROP1, TAF3, H2AFY2, ELF5, ZBTB16, CNOT1 Y TADA2A, involucrados en regulación transcripcional, así como los genes homeóticos HOXA5 y HOXA6.


REFERENCIA